Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X4

Ilf3, Interleukin enhancer-binding factor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ilf3Q9Z1X4 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ilf3Q9Z1X4 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ilf3Q9Z1X4 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ilf3Q9Z1X4 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ilf3Q9Z1X4 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ilf3Q9Z1X4 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ilf3Q9Z1X4 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ilf3Q9Z1X4 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ilf3Q9Z1X4 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ilf3Q9Z1X4 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ilf3Q9Z1X4 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ilf3Q9Z1X4 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ilf3Q9Z1X4 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ilf3Q9Z1X4 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ilf3Q9Z1X4 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ilf3Q9Z1X4 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ilf3Q9Z1X4 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ilf3Q9Z1X4 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ilf3Q9Z1X4 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ilf3Q9Z1X4 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ilf3Q9Z1X4 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ilf3Q9Z1X4 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ilf3Q9Z1X4 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ilf3Q9Z1X4 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ilf3Q9Z1X4 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ilf3Q9Z1X4 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ilf3Q9Z1X4 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ilf3Q9Z1X4 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ilf3Q9Z1X4 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ilf3Q9Z1X4 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ilf3Q9Z1X4 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ilf3Q9Z1X4 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ilf3Q9Z1X4 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ilf3Q9Z1X4 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ilf3Q9Z1X4 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ilf3Q9Z1X4 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ilf3Q9Z1X4 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ilf3Q9Z1X4 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ilf3Q9Z1X4 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ilf3Q9Z1X4 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ilf3Q9Z1X4 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ilf3Q9Z1X4 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ilf3Q9Z1X4 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ilf3Q9Z1X4 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ilf3Q9Z1X4 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ilf3Q9Z1X4 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ilf3Q9Z1X4 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ilf3Q9Z1X4 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ilf3Q9Z1X4 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ilf3Q9Z1X4 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ilf3Q9Z1X4 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ilf3Q9Z1X4 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ilf3Q9Z1X4 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ilf3Q9Z1X4 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ilf3Q9Z1X4 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ilf3Q9Z1X4 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ilf3Q9Z1X4 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ilf3Q9Z1X4 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ilf3Q9Z1X4 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ilf3Q9Z1X4 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ilf3Q9Z1X4 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ilf3Q9Z1X4 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ilf3Q9Z1X4 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ilf3Q9Z1X4 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ilf3Q9Z1X4 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ilf3Q9Z1X4 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ilf3Q9Z1X4 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ilf3Q9Z1X4 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ilf3Q9Z1X4 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ilf3Q9Z1X4 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ilf3Q9Z1X4 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ilf3Q9Z1X4 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ilf3Q9Z1X4 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ilf3Q9Z1X4 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ilf3Q9Z1X4 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ilf3Q9Z1X4 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ilf3Q9Z1X4 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ilf3Q9Z1X4 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ilf3Q9Z1X4 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ilf3Q9Z1X4 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ilf3Q9Z1X4 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ilf3Q9Z1X4 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ilf3Q9Z1X4 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ilf3Q9Z1X4 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ilf3Q9Z1X4 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ilf3Q9Z1X4 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ilf3Q9Z1X4 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ilf3Q9Z1X4 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ilf3Q9Z1X4 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ilf3Q9Z1X4 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ilf3Q9Z1X4 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ilf3Q9Z1X4 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ilf3Q9Z1X4 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ilf3Q9Z1X4 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ilf3Q9Z1X4 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ilf3Q9Z1X4 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ilf3Q9Z1X4 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ilf3Q9Z1X4 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ilf3Q9Z1X4 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ilf3Q9Z1X4 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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