Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Z3

Skp2, S-phase kinase-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp2Q9Z0Z3 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Skp2Q9Z0Z3 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Skp2Q9Z0Z3 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Skp2Q9Z0Z3 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Skp2Q9Z0Z3 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Skp2Q9Z0Z3 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Skp2Q9Z0Z3 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Skp2Q9Z0Z3 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Skp2Q9Z0Z3 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms