Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W3

Nup160, Nuclear pore complex protein Nup160, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup160Q9Z0W3 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nup160Q9Z0W3 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nup160Q9Z0W3 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nup160Q9Z0W3 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nup160Q9Z0W3 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nup160Q9Z0W3 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nup160Q9Z0W3 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nup160Q9Z0W3 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nup160Q9Z0W3 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nup160Q9Z0W3 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nup160Q9Z0W3 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Nup160Q9Z0W3 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nup160Q9Z0W3 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Nup160Q9Z0W3 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nup160Q9Z0W3 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nup160Q9Z0W3 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nup160Q9Z0W3 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nup160Q9Z0W3 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nup160Q9Z0W3 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nup160Q9Z0W3 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nup160Q9Z0W3 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nup160Q9Z0W3 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nup160Q9Z0W3 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Nup160Q9Z0W3 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Nup160Q9Z0W3 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nup160Q9Z0W3 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nup160Q9Z0W3 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nup160Q9Z0W3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nup160Q9Z0W3 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nup160Q9Z0W3 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nup160Q9Z0W3 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nup160Q9Z0W3 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nup160Q9Z0W3 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nup160Q9Z0W3 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nup160Q9Z0W3 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nup160Q9Z0W3 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nup160Q9Z0W3 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nup160Q9Z0W3 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Nup160Q9Z0W3 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Nup160Q9Z0W3 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Nup160Q9Z0W3 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Nup160Q9Z0W3 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nup160Q9Z0W3 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nup160Q9Z0W3 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nup160Q9Z0W3 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nup160Q9Z0W3 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nup160Q9Z0W3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nup160Q9Z0W3 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nup160Q9Z0W3 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nup160Q9Z0W3 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nup160Q9Z0W3 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nup160Q9Z0W3 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nup160Q9Z0W3 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Nup160Q9Z0W3 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Nup160Q9Z0W3 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Nup160Q9Z0W3 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nup160Q9Z0W3 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Nup160Q9Z0W3 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nup160Q9Z0W3 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nup160Q9Z0W3 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Nup160Q9Z0W3 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nup160Q9Z0W3 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nup160Q9Z0W3 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nup160Q9Z0W3 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nup160Q9Z0W3 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nup160Q9Z0W3 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nup160Q9Z0W3 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nup160Q9Z0W3 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nup160Q9Z0W3 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nup160Q9Z0W3 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Nup160Q9Z0W3 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Nup160Q9Z0W3 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Nup160Q9Z0W3 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nup160Q9Z0W3 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nup160Q9Z0W3 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Nup160Q9Z0W3 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nup160Q9Z0W3 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Nup160Q9Z0W3 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nup160Q9Z0W3 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nup160Q9Z0W3 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nup160Q9Z0W3 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nup160Q9Z0W3 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nup160Q9Z0W3 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nup160Q9Z0W3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nup160Q9Z0W3 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nup160Q9Z0W3 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nup160Q9Z0W3 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nup160Q9Z0W3 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nup160Q9Z0W3 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Nup160Q9Z0W3 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Nup160Q9Z0W3 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nup160Q9Z0W3 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Nup160Q9Z0W3 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nup160Q9Z0W3 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nup160Q9Z0W3 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Nup160Q9Z0W3 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nup160Q9Z0W3 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nup160Q9Z0W3 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nup160Q9Z0W3 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nup160Q9Z0W3 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms