Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn13Q9Z0S4 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms