Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0G9

Cldn3, Claudin-3, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn3Q9Z0G9 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn3Q9Z0G9 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn3Q9Z0G9 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn3Q9Z0G9 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn3Q9Z0G9 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn3Q9Z0G9 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn3Q9Z0G9 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn3Q9Z0G9 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn3Q9Z0G9 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn3Q9Z0G9 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn3Q9Z0G9 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn3Q9Z0G9 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn3Q9Z0G9 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn3Q9Z0G9 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn3Q9Z0G9 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn3Q9Z0G9 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn3Q9Z0G9 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn3Q9Z0G9 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn3Q9Z0G9 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn3Q9Z0G9 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn3Q9Z0G9 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn3Q9Z0G9 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn3Q9Z0G9 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn3Q9Z0G9 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn3Q9Z0G9 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn3Q9Z0G9 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn3Q9Z0G9 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn3Q9Z0G9 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn3Q9Z0G9 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn3Q9Z0G9 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn3Q9Z0G9 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn3Q9Z0G9 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn3Q9Z0G9 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn3Q9Z0G9 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn3Q9Z0G9 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn3Q9Z0G9 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn3Q9Z0G9 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn3Q9Z0G9 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn3Q9Z0G9 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn3Q9Z0G9 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn3Q9Z0G9 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn3Q9Z0G9 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn3Q9Z0G9 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn3Q9Z0G9 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn3Q9Z0G9 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn3Q9Z0G9 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn3Q9Z0G9 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn3Q9Z0G9 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn3Q9Z0G9 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn3Q9Z0G9 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn3Q9Z0G9 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn3Q9Z0G9 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn3Q9Z0G9 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn3Q9Z0G9 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn3Q9Z0G9 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn3Q9Z0G9 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn3Q9Z0G9 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn3Q9Z0G9 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn3Q9Z0G9 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn3Q9Z0G9 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn3Q9Z0G9 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn3Q9Z0G9 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn3Q9Z0G9 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn3Q9Z0G9 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn3Q9Z0G9 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn3Q9Z0G9 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn3Q9Z0G9 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn3Q9Z0G9 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn3Q9Z0G9 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Cldn3Q9Z0G9 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn3Q9Z0G9 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn3Q9Z0G9 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn3Q9Z0G9 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn3Q9Z0G9 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn3Q9Z0G9 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn3Q9Z0G9 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn3Q9Z0G9 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn3Q9Z0G9 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn3Q9Z0G9 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn3Q9Z0G9 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn3Q9Z0G9 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn3Q9Z0G9 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn3Q9Z0G9 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn3Q9Z0G9 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn3Q9Z0G9 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn3Q9Z0G9 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn3Q9Z0G9 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn3Q9Z0G9 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn3Q9Z0G9 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn3Q9Z0G9 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn3Q9Z0G9 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn3Q9Z0G9 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn3Q9Z0G9 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn3Q9Z0G9 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn3Q9Z0G9 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn3Q9Z0G9 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn3Q9Z0G9 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn3Q9Z0G9 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn3Q9Z0G9 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms