Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E3

Aire, Autoimmune regulator, mousemouse

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Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AireQ9Z0E3 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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