Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVP6

Papolb, Poly(A) polymerase beta, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PapolbQ9WVP6 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PapolbQ9WVP6 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PapolbQ9WVP6 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PapolbQ9WVP6 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PapolbQ9WVP6 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PapolbQ9WVP6 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PapolbQ9WVP6 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PapolbQ9WVP6 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PapolbQ9WVP6 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PapolbQ9WVP6 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PapolbQ9WVP6 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PapolbQ9WVP6 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PapolbQ9WVP6 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PapolbQ9WVP6 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PapolbQ9WVP6 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PapolbQ9WVP6 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PapolbQ9WVP6 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PapolbQ9WVP6 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PapolbQ9WVP6 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PapolbQ9WVP6 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PapolbQ9WVP6 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PapolbQ9WVP6 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PapolbQ9WVP6 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PapolbQ9WVP6 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PapolbQ9WVP6 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PapolbQ9WVP6 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PapolbQ9WVP6 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PapolbQ9WVP6 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PapolbQ9WVP6 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PapolbQ9WVP6 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PapolbQ9WVP6 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PapolbQ9WVP6 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PapolbQ9WVP6 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PapolbQ9WVP6 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PapolbQ9WVP6 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PapolbQ9WVP6 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PapolbQ9WVP6 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PapolbQ9WVP6 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PapolbQ9WVP6 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PapolbQ9WVP6 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PapolbQ9WVP6 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PapolbQ9WVP6 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PapolbQ9WVP6 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PapolbQ9WVP6 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PapolbQ9WVP6 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PapolbQ9WVP6 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PapolbQ9WVP6 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PapolbQ9WVP6 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PapolbQ9WVP6 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PapolbQ9WVP6 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PapolbQ9WVP6 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PapolbQ9WVP6 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PapolbQ9WVP6 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
PapolbQ9WVP6 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PapolbQ9WVP6 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PapolbQ9WVP6 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PapolbQ9WVP6 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PapolbQ9WVP6 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PapolbQ9WVP6 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PapolbQ9WVP6 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PapolbQ9WVP6 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PapolbQ9WVP6 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PapolbQ9WVP6 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PapolbQ9WVP6 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PapolbQ9WVP6 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PapolbQ9WVP6 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PapolbQ9WVP6 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PapolbQ9WVP6 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PapolbQ9WVP6 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PapolbQ9WVP6 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PapolbQ9WVP6 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PapolbQ9WVP6 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PapolbQ9WVP6 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PapolbQ9WVP6 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PapolbQ9WVP6 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PapolbQ9WVP6 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PapolbQ9WVP6 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PapolbQ9WVP6 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PapolbQ9WVP6 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PapolbQ9WVP6 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PapolbQ9WVP6 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PapolbQ9WVP6 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PapolbQ9WVP6 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PapolbQ9WVP6 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PapolbQ9WVP6 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PapolbQ9WVP6 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PapolbQ9WVP6 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PapolbQ9WVP6 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PapolbQ9WVP6 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PapolbQ9WVP6 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PapolbQ9WVP6 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PapolbQ9WVP6 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PapolbQ9WVP6 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PapolbQ9WVP6 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PapolbQ9WVP6 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PapolbQ9WVP6 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PapolbQ9WVP6 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PapolbQ9WVP6 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PapolbQ9WVP6 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PapolbQ9WVP6 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms