Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV35

Apobec2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec2Q9WV35 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apobec2Q9WV35 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apobec2Q9WV35 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apobec2Q9WV35 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apobec2Q9WV35 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apobec2Q9WV35 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apobec2Q9WV35 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apobec2Q9WV35 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apobec2Q9WV35 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apobec2Q9WV35 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apobec2Q9WV35 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apobec2Q9WV35 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apobec2Q9WV35 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apobec2Q9WV35 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apobec2Q9WV35 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apobec2Q9WV35 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apobec2Q9WV35 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apobec2Q9WV35 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apobec2Q9WV35 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apobec2Q9WV35 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apobec2Q9WV35 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apobec2Q9WV35 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apobec2Q9WV35 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apobec2Q9WV35 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apobec2Q9WV35 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apobec2Q9WV35 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apobec2Q9WV35 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Apobec2Q9WV35 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apobec2Q9WV35 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apobec2Q9WV35 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apobec2Q9WV35 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apobec2Q9WV35 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apobec2Q9WV35 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apobec2Q9WV35 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apobec2Q9WV35 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apobec2Q9WV35 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apobec2Q9WV35 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apobec2Q9WV35 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apobec2Q9WV35 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apobec2Q9WV35 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apobec2Q9WV35 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apobec2Q9WV35 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apobec2Q9WV35 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apobec2Q9WV35 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apobec2Q9WV35 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apobec2Q9WV35 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apobec2Q9WV35 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apobec2Q9WV35 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apobec2Q9WV35 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Apobec2Q9WV35 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apobec2Q9WV35 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apobec2Q9WV35 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apobec2Q9WV35 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apobec2Q9WV35 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apobec2Q9WV35 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apobec2Q9WV35 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apobec2Q9WV35 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apobec2Q9WV35 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Apobec2Q9WV35 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apobec2Q9WV35 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apobec2Q9WV35 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apobec2Q9WV35 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apobec2Q9WV35 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apobec2Q9WV35 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apobec2Q9WV35 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apobec2Q9WV35 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Apobec2Q9WV35 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apobec2Q9WV35 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apobec2Q9WV35 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apobec2Q9WV35 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apobec2Q9WV35 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apobec2Q9WV35 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apobec2Q9WV35 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apobec2Q9WV35 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apobec2Q9WV35 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apobec2Q9WV35 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apobec2Q9WV35 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apobec2Q9WV35 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apobec2Q9WV35 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apobec2Q9WV35 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apobec2Q9WV35 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apobec2Q9WV35 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apobec2Q9WV35 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apobec2Q9WV35 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apobec2Q9WV35 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apobec2Q9WV35 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Apobec2Q9WV35 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Apobec2Q9WV35 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apobec2Q9WV35 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Apobec2Q9WV35 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apobec2Q9WV35 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apobec2Q9WV35 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apobec2Q9WV35 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apobec2Q9WV35 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apobec2Q9WV35 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apobec2Q9WV35 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apobec2Q9WV35 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apobec2Q9WV35 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apobec2Q9WV35 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apobec2Q9WV35 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms