Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTV6

Usp18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp18Q9WTV6 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp18Q9WTV6 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp18Q9WTV6 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp18Q9WTV6 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp18Q9WTV6 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp18Q9WTV6 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp18Q9WTV6 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp18Q9WTV6 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp18Q9WTV6 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp18Q9WTV6 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp18Q9WTV6 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp18Q9WTV6 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp18Q9WTV6 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp18Q9WTV6 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp18Q9WTV6 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp18Q9WTV6 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp18Q9WTV6 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp18Q9WTV6 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp18Q9WTV6 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Usp18Q9WTV6 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp18Q9WTV6 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp18Q9WTV6 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp18Q9WTV6 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp18Q9WTV6 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp18Q9WTV6 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp18Q9WTV6 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp18Q9WTV6 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp18Q9WTV6 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp18Q9WTV6 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp18Q9WTV6 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp18Q9WTV6 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp18Q9WTV6 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp18Q9WTV6 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp18Q9WTV6 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp18Q9WTV6 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp18Q9WTV6 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp18Q9WTV6 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp18Q9WTV6 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Usp18Q9WTV6 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp18Q9WTV6 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Usp18Q9WTV6 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Usp18Q9WTV6 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp18Q9WTV6 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp18Q9WTV6 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp18Q9WTV6 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Usp18Q9WTV6 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp18Q9WTV6 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp18Q9WTV6 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Usp18Q9WTV6 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Usp18Q9WTV6 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp18Q9WTV6 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp18Q9WTV6 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp18Q9WTV6 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp18Q9WTV6 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp18Q9WTV6 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp18Q9WTV6 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp18Q9WTV6 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Usp18Q9WTV6 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp18Q9WTV6 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp18Q9WTV6 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp18Q9WTV6 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp18Q9WTV6 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp18Q9WTV6 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp18Q9WTV6 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp18Q9WTV6 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp18Q9WTV6 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp18Q9WTV6 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp18Q9WTV6 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp18Q9WTV6 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp18Q9WTV6 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp18Q9WTV6 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp18Q9WTV6 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp18Q9WTV6 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp18Q9WTV6 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp18Q9WTV6 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp18Q9WTV6 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp18Q9WTV6 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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