Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0G8

Nrk, Nik-related protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrkQ9R0G8 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NrkQ9R0G8 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NrkQ9R0G8 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NrkQ9R0G8 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NrkQ9R0G8 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NrkQ9R0G8 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NrkQ9R0G8 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NrkQ9R0G8 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NrkQ9R0G8 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NrkQ9R0G8 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NrkQ9R0G8 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NrkQ9R0G8 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NrkQ9R0G8 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NrkQ9R0G8 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
NrkQ9R0G8 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NrkQ9R0G8 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NrkQ9R0G8 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NrkQ9R0G8 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NrkQ9R0G8 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NrkQ9R0G8 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NrkQ9R0G8 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NrkQ9R0G8 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NrkQ9R0G8 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NrkQ9R0G8 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NrkQ9R0G8 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NrkQ9R0G8 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NrkQ9R0G8 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NrkQ9R0G8 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NrkQ9R0G8 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NrkQ9R0G8 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NrkQ9R0G8 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NrkQ9R0G8 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NrkQ9R0G8 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NrkQ9R0G8 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NrkQ9R0G8 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NrkQ9R0G8 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NrkQ9R0G8 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NrkQ9R0G8 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NrkQ9R0G8 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NrkQ9R0G8 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NrkQ9R0G8 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NrkQ9R0G8 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NrkQ9R0G8 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NrkQ9R0G8 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NrkQ9R0G8 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NrkQ9R0G8 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
NrkQ9R0G8 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NrkQ9R0G8 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NrkQ9R0G8 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NrkQ9R0G8 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NrkQ9R0G8 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NrkQ9R0G8 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NrkQ9R0G8 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NrkQ9R0G8 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NrkQ9R0G8 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NrkQ9R0G8 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
NrkQ9R0G8 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NrkQ9R0G8 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
NrkQ9R0G8 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
NrkQ9R0G8 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NrkQ9R0G8 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NrkQ9R0G8 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NrkQ9R0G8 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
NrkQ9R0G8 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NrkQ9R0G8 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NrkQ9R0G8 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NrkQ9R0G8 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NrkQ9R0G8 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NrkQ9R0G8 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NrkQ9R0G8 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NrkQ9R0G8 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NrkQ9R0G8 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NrkQ9R0G8 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NrkQ9R0G8 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NrkQ9R0G8 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NrkQ9R0G8 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NrkQ9R0G8 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NrkQ9R0G8 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NrkQ9R0G8 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NrkQ9R0G8 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NrkQ9R0G8 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NrkQ9R0G8 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NrkQ9R0G8 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NrkQ9R0G8 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NrkQ9R0G8 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NrkQ9R0G8 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NrkQ9R0G8 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NrkQ9R0G8 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NrkQ9R0G8 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NrkQ9R0G8 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NrkQ9R0G8 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NrkQ9R0G8 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NrkQ9R0G8 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NrkQ9R0G8 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NrkQ9R0G8 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NrkQ9R0G8 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NrkQ9R0G8 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NrkQ9R0G8 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NrkQ9R0G8 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NrkQ9R0G8 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms