Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E1

Plod3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod3Q9R0E1 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Plod3Q9R0E1 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Plod3Q9R0E1 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Plod3Q9R0E1 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Plod3Q9R0E1 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Plod3Q9R0E1 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Plod3Q9R0E1 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Plod3Q9R0E1 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Plod3Q9R0E1 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Plod3Q9R0E1 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Plod3Q9R0E1 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Plod3Q9R0E1 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Plod3Q9R0E1 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Plod3Q9R0E1 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Plod3Q9R0E1 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Plod3Q9R0E1 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Plod3Q9R0E1 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Plod3Q9R0E1 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Plod3Q9R0E1 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Plod3Q9R0E1 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Plod3Q9R0E1 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Plod3Q9R0E1 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Plod3Q9R0E1 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Plod3Q9R0E1 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Plod3Q9R0E1 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Plod3Q9R0E1 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Plod3Q9R0E1 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Plod3Q9R0E1 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Plod3Q9R0E1 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Plod3Q9R0E1 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Plod3Q9R0E1 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Plod3Q9R0E1 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Plod3Q9R0E1 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Plod3Q9R0E1 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Plod3Q9R0E1 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Plod3Q9R0E1 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Plod3Q9R0E1 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Plod3Q9R0E1 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Plod3Q9R0E1 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Plod3Q9R0E1 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Plod3Q9R0E1 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Plod3Q9R0E1 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Plod3Q9R0E1 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Plod3Q9R0E1 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Plod3Q9R0E1 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Plod3Q9R0E1 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Plod3Q9R0E1 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Plod3Q9R0E1 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Plod3Q9R0E1 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Plod3Q9R0E1 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Plod3Q9R0E1 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Plod3Q9R0E1 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Plod3Q9R0E1 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Plod3Q9R0E1 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Plod3Q9R0E1 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Plod3Q9R0E1 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Plod3Q9R0E1 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Plod3Q9R0E1 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Plod3Q9R0E1 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Plod3Q9R0E1 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Plod3Q9R0E1 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Plod3Q9R0E1 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Plod3Q9R0E1 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Plod3Q9R0E1 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Plod3Q9R0E1 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Plod3Q9R0E1 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Plod3Q9R0E1 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Plod3Q9R0E1 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Plod3Q9R0E1 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Plod3Q9R0E1 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Plod3Q9R0E1 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Plod3Q9R0E1 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Plod3Q9R0E1 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Plod3Q9R0E1 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms