Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0C8

Vav3, Guanine nucleotide exchange factor VAV3, mousemouse

Predictions only

Length 847 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav3Q9R0C8 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vav3Q9R0C8 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vav3Q9R0C8 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vav3Q9R0C8 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vav3Q9R0C8 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Vav3Q9R0C8 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vav3Q9R0C8 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vav3Q9R0C8 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vav3Q9R0C8 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vav3Q9R0C8 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vav3Q9R0C8 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vav3Q9R0C8 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vav3Q9R0C8 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Vav3Q9R0C8 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vav3Q9R0C8 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Vav3Q9R0C8 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Vav3Q9R0C8 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Vav3Q9R0C8 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Vav3Q9R0C8 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vav3Q9R0C8 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vav3Q9R0C8 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vav3Q9R0C8 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vav3Q9R0C8 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vav3Q9R0C8 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vav3Q9R0C8 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vav3Q9R0C8 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vav3Q9R0C8 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vav3Q9R0C8 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vav3Q9R0C8 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vav3Q9R0C8 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vav3Q9R0C8 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vav3Q9R0C8 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vav3Q9R0C8 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vav3Q9R0C8 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vav3Q9R0C8 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vav3Q9R0C8 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vav3Q9R0C8 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vav3Q9R0C8 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vav3Q9R0C8 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vav3Q9R0C8 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vav3Q9R0C8 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vav3Q9R0C8 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vav3Q9R0C8 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vav3Q9R0C8 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vav3Q9R0C8 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Vav3Q9R0C8 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Vav3Q9R0C8 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vav3Q9R0C8 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vav3Q9R0C8 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vav3Q9R0C8 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vav3Q9R0C8 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vav3Q9R0C8 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vav3Q9R0C8 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Vav3Q9R0C8 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vav3Q9R0C8 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vav3Q9R0C8 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vav3Q9R0C8 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vav3Q9R0C8 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vav3Q9R0C8 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vav3Q9R0C8 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vav3Q9R0C8 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vav3Q9R0C8 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vav3Q9R0C8 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vav3Q9R0C8 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vav3Q9R0C8 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vav3Q9R0C8 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vav3Q9R0C8 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vav3Q9R0C8 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vav3Q9R0C8 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vav3Q9R0C8 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vav3Q9R0C8 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vav3Q9R0C8 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vav3Q9R0C8 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vav3Q9R0C8 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vav3Q9R0C8 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vav3Q9R0C8 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vav3Q9R0C8 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vav3Q9R0C8 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vav3Q9R0C8 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vav3Q9R0C8 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vav3Q9R0C8 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vav3Q9R0C8 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vav3Q9R0C8 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vav3Q9R0C8 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vav3Q9R0C8 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vav3Q9R0C8 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vav3Q9R0C8 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vav3Q9R0C8 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vav3Q9R0C8 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vav3Q9R0C8 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vav3Q9R0C8 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vav3Q9R0C8 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vav3Q9R0C8 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vav3Q9R0C8 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vav3Q9R0C8 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vav3Q9R0C8 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vav3Q9R0C8 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vav3Q9R0C8 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vav3Q9R0C8 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vav3Q9R0C8 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms