Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nek3Q9R0A5 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nek3Q9R0A5 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nek3Q9R0A5 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Nek3Q9R0A5 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nek3Q9R0A5 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nek3Q9R0A5 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nek3Q9R0A5 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Nek3Q9R0A5 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nek3Q9R0A5 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nek3Q9R0A5 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nek3Q9R0A5 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nek3Q9R0A5 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nek3Q9R0A5 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nek3Q9R0A5 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nek3Q9R0A5 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nek3Q9R0A5 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nek3Q9R0A5 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nek3Q9R0A5 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Nek3Q9R0A5 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nek3Q9R0A5 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nek3Q9R0A5 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nek3Q9R0A5 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nek3Q9R0A5 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nek3Q9R0A5 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nek3Q9R0A5 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nek3Q9R0A5 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nek3Q9R0A5 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nek3Q9R0A5 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nek3Q9R0A5 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nek3Q9R0A5 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Nek3Q9R0A5 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nek3Q9R0A5 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nek3Q9R0A5 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nek3Q9R0A5 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nek3Q9R0A5 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nek3Q9R0A5 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nek3Q9R0A5 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nek3Q9R0A5 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nek3Q9R0A5 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nek3Q9R0A5 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nek3Q9R0A5 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nek3Q9R0A5 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nek3Q9R0A5 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nek3Q9R0A5 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nek3Q9R0A5 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nek3Q9R0A5 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nek3Q9R0A5 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nek3Q9R0A5 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nek3Q9R0A5 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nek3Q9R0A5 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nek3Q9R0A5 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nek3Q9R0A5 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nek3Q9R0A5 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nek3Q9R0A5 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nek3Q9R0A5 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nek3Q9R0A5 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Nek3Q9R0A5 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nek3Q9R0A5 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nek3Q9R0A5 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nek3Q9R0A5 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nek3Q9R0A5 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nek3Q9R0A5 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nek3Q9R0A5 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nek3Q9R0A5 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nek3Q9R0A5 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nek3Q9R0A5 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nek3Q9R0A5 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nek3Q9R0A5 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nek3Q9R0A5 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nek3Q9R0A5 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nek3Q9R0A5 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nek3Q9R0A5 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nek3Q9R0A5 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nek3Q9R0A5 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nek3Q9R0A5 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nek3Q9R0A5 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nek3Q9R0A5 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nek3Q9R0A5 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nek3Q9R0A5 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nek3Q9R0A5 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nek3Q9R0A5 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nek3Q9R0A5 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nek3Q9R0A5 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nek3Q9R0A5 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nek3Q9R0A5 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nek3Q9R0A5 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nek3Q9R0A5 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nek3Q9R0A5 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nek3Q9R0A5 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nek3Q9R0A5 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nek3Q9R0A5 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nek3Q9R0A5 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nek3Q9R0A5 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nek3Q9R0A5 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nek3Q9R0A5 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nek3Q9R0A5 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nek3Q9R0A5 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nek3Q9R0A5 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nek3Q9R0A5 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms