Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rnf4Q9QZS2 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rnf4Q9QZS2 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rnf4Q9QZS2 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rnf4Q9QZS2 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rnf4Q9QZS2 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rnf4Q9QZS2 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rnf4Q9QZS2 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rnf4Q9QZS2 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rnf4Q9QZS2 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rnf4Q9QZS2 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rnf4Q9QZS2 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rnf4Q9QZS2 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rnf4Q9QZS2 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf4Q9QZS2 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf4Q9QZS2 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf4Q9QZS2 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf4Q9QZS2 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf4Q9QZS2 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf4Q9QZS2 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf4Q9QZS2 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf4Q9QZS2 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Rnf4Q9QZS2 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf4Q9QZS2 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf4Q9QZS2 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf4Q9QZS2 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf4Q9QZS2 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf4Q9QZS2 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf4Q9QZS2 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf4Q9QZS2 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf4Q9QZS2 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf4Q9QZS2 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf4Q9QZS2 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf4Q9QZS2 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf4Q9QZS2 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf4Q9QZS2 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf4Q9QZS2 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf4Q9QZS2 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf4Q9QZS2 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf4Q9QZS2 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf4Q9QZS2 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf4Q9QZS2 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf4Q9QZS2 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf4Q9QZS2 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf4Q9QZS2 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf4Q9QZS2 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf4Q9QZS2 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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