Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Col4a3Q9QZS0 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col4a3Q9QZS0 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col4a3Q9QZS0 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col4a3Q9QZS0 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col4a3Q9QZS0 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col4a3Q9QZS0 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col4a3Q9QZS0 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col4a3Q9QZS0 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col4a3Q9QZS0 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col4a3Q9QZS0 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col4a3Q9QZS0 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col4a3Q9QZS0 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col4a3Q9QZS0 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col4a3Q9QZS0 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col4a3Q9QZS0 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Col4a3Q9QZS0 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col4a3Q9QZS0 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Col4a3Q9QZS0 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col4a3Q9QZS0 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col4a3Q9QZS0 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col4a3Q9QZS0 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col4a3Q9QZS0 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col4a3Q9QZS0 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col4a3Q9QZS0 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col4a3Q9QZS0 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col4a3Q9QZS0 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col4a3Q9QZS0 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col4a3Q9QZS0 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col4a3Q9QZS0 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col4a3Q9QZS0 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Col4a3Q9QZS0 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col4a3Q9QZS0 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col4a3Q9QZS0 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col4a3Q9QZS0 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col4a3Q9QZS0 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Col4a3Q9QZS0 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Col4a3Q9QZS0 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Col4a3Q9QZS0 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col4a3Q9QZS0 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col4a3Q9QZS0 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col4a3Q9QZS0 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Col4a3Q9QZS0 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col4a3Q9QZS0 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col4a3Q9QZS0 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col4a3Q9QZS0 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col4a3Q9QZS0 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col4a3Q9QZS0 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col4a3Q9QZS0 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col4a3Q9QZS0 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col4a3Q9QZS0 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col4a3Q9QZS0 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col4a3Q9QZS0 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col4a3Q9QZS0 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col4a3Q9QZS0 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col4a3Q9QZS0 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col4a3Q9QZS0 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col4a3Q9QZS0 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col4a3Q9QZS0 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col4a3Q9QZS0 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Col4a3Q9QZS0 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Col4a3Q9QZS0 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Col4a3Q9QZS0 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Col4a3Q9QZS0 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col4a3Q9QZS0 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col4a3Q9QZS0 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col4a3Q9QZS0 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col4a3Q9QZS0 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col4a3Q9QZS0 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col4a3Q9QZS0 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
Col4a3Q9QZS0 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Col4a3Q9QZS0 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Col4a3Q9QZS0 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Col4a3Q9QZS0 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Col4a3Q9QZS0 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Col4a3Q9QZS0 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
Col4a3Q9QZS0 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Col4a3Q9QZS0 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col4a3Q9QZS0 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col4a3Q9QZS0 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col4a3Q9QZS0 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col4a3Q9QZS0 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col4a3Q9QZS0 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col4a3Q9QZS0 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col4a3Q9QZS0 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col4a3Q9QZS0 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col4a3Q9QZS0 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col4a3Q9QZS0 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col4a3Q9QZS0 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col4a3Q9QZS0 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col4a3Q9QZS0 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Col4a3Q9QZS0 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col4a3Q9QZS0 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col4a3Q9QZS0 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col4a3Q9QZS0 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col4a3Q9QZS0 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col4a3Q9QZS0 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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