Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY23

Pkp3, Plakophilin-3, mousemouse

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp3Q9QY23 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkp3Q9QY23 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkp3Q9QY23 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkp3Q9QY23 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkp3Q9QY23 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkp3Q9QY23 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkp3Q9QY23 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkp3Q9QY23 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Pkp3Q9QY23 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkp3Q9QY23 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkp3Q9QY23 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkp3Q9QY23 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Pkp3Q9QY23 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
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Pkp3Q9QY23 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkp3Q9QY23 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkp3Q9QY23 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkp3Q9QY23 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkp3Q9QY23 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkp3Q9QY23 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkp3Q9QY23 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkp3Q9QY23 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkp3Q9QY23 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkp3Q9QY23 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Pkp3Q9QY23 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
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Pkp3Q9QY23 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Pkp3Q9QY23 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Pkp3Q9QY23 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Pkp3Q9QY23 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Pkp3Q9QY23 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms