Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV1

Cbx8, Chromobox protein homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx8Q9QXV1 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cbx8Q9QXV1 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms