Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ChmQ9QXG2 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ChmQ9QXG2 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ChmQ9QXG2 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ChmQ9QXG2 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ChmQ9QXG2 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ChmQ9QXG2 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ChmQ9QXG2 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ChmQ9QXG2 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ChmQ9QXG2 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ChmQ9QXG2 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ChmQ9QXG2 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ChmQ9QXG2 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ChmQ9QXG2 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ChmQ9QXG2 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ChmQ9QXG2 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ChmQ9QXG2 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ChmQ9QXG2 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ChmQ9QXG2 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ChmQ9QXG2 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ChmQ9QXG2 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ChmQ9QXG2 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ChmQ9QXG2 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ChmQ9QXG2 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ChmQ9QXG2 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ChmQ9QXG2 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ChmQ9QXG2 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ChmQ9QXG2 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ChmQ9QXG2 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ChmQ9QXG2 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ChmQ9QXG2 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ChmQ9QXG2 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ChmQ9QXG2 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ChmQ9QXG2 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ChmQ9QXG2 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ChmQ9QXG2 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ChmQ9QXG2 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ChmQ9QXG2 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ChmQ9QXG2 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ChmQ9QXG2 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ChmQ9QXG2 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ChmQ9QXG2 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ChmQ9QXG2 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ChmQ9QXG2 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ChmQ9QXG2 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ChmQ9QXG2 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ChmQ9QXG2 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ChmQ9QXG2 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ChmQ9QXG2 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ChmQ9QXG2 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ChmQ9QXG2 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ChmQ9QXG2 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ChmQ9QXG2 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ChmQ9QXG2 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ChmQ9QXG2 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ChmQ9QXG2 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ChmQ9QXG2 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ChmQ9QXG2 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ChmQ9QXG2 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ChmQ9QXG2 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ChmQ9QXG2 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ChmQ9QXG2 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ChmQ9QXG2 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms