Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Limd1Q9QXD8 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Limd1Q9QXD8 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Limd1Q9QXD8 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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