Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWW1

Homer2, Homer protein homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer2Q9QWW1 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Homer2Q9QWW1 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Homer2Q9QWW1 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Homer2Q9QWW1 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Homer2Q9QWW1 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Homer2Q9QWW1 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Homer2Q9QWW1 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Homer2Q9QWW1 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms