Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC6

Tef, Thyrotroph embryonic factor, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TefQ9JLC6 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TefQ9JLC6 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TefQ9JLC6 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TefQ9JLC6 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TefQ9JLC6 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TefQ9JLC6 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TefQ9JLC6 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TefQ9JLC6 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TefQ9JLC6 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TefQ9JLC6 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TefQ9JLC6 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TefQ9JLC6 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TefQ9JLC6 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TefQ9JLC6 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TefQ9JLC6 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TefQ9JLC6 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TefQ9JLC6 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TefQ9JLC6 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TefQ9JLC6 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TefQ9JLC6 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TefQ9JLC6 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TefQ9JLC6 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TefQ9JLC6 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TefQ9JLC6 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TefQ9JLC6 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TefQ9JLC6 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TefQ9JLC6 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TefQ9JLC6 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TefQ9JLC6 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TefQ9JLC6 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TefQ9JLC6 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TefQ9JLC6 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TefQ9JLC6 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TefQ9JLC6 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TefQ9JLC6 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TefQ9JLC6 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TefQ9JLC6 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TefQ9JLC6 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TefQ9JLC6 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TefQ9JLC6 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TefQ9JLC6 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TefQ9JLC6 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TefQ9JLC6 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TefQ9JLC6 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TefQ9JLC6 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TefQ9JLC6 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TefQ9JLC6 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TefQ9JLC6 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TefQ9JLC6 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TefQ9JLC6 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TefQ9JLC6 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TefQ9JLC6 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TefQ9JLC6 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TefQ9JLC6 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TefQ9JLC6 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
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TefQ9JLC6 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TefQ9JLC6 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
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TefQ9JLC6 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TefQ9JLC6 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TefQ9JLC6 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TefQ9JLC6 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TefQ9JLC6 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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TefQ9JLC6 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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TefQ9JLC6 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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TefQ9JLC6 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TefQ9JLC6 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TefQ9JLC6 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TefQ9JLC6 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TefQ9JLC6 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TefQ9JLC6 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
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TefQ9JLC6 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TefQ9JLC6 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TefQ9JLC6 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TefQ9JLC6 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TefQ9JLC6 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TefQ9JLC6 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TefQ9JLC6 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TefQ9JLC6 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TefQ9JLC6 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TefQ9JLC6 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TefQ9JLC6 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TefQ9JLC6 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TefQ9JLC6 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TefQ9JLC6 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TefQ9JLC6 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TefQ9JLC6 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TefQ9JLC6 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TefQ9JLC6 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms