Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL96

Ctsm, Cathepsin M, mousemouse

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Length 333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsmQ9JL96 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtsmQ9JL96 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtsmQ9JL96 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtsmQ9JL96 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CtsmQ9JL96 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtsmQ9JL96 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtsmQ9JL96 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtsmQ9JL96 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtsmQ9JL96 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtsmQ9JL96 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtsmQ9JL96 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtsmQ9JL96 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtsmQ9JL96 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtsmQ9JL96 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtsmQ9JL96 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtsmQ9JL96 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtsmQ9JL96 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtsmQ9JL96 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtsmQ9JL96 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtsmQ9JL96 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtsmQ9JL96 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CtsmQ9JL96 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CtsmQ9JL96 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtsmQ9JL96 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtsmQ9JL96 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtsmQ9JL96 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtsmQ9JL96 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtsmQ9JL96 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtsmQ9JL96 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtsmQ9JL96 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtsmQ9JL96 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtsmQ9JL96 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtsmQ9JL96 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtsmQ9JL96 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtsmQ9JL96 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtsmQ9JL96 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtsmQ9JL96 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtsmQ9JL96 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtsmQ9JL96 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtsmQ9JL96 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtsmQ9JL96 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtsmQ9JL96 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtsmQ9JL96 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtsmQ9JL96 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtsmQ9JL96 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtsmQ9JL96 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtsmQ9JL96 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtsmQ9JL96 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CtsmQ9JL96 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtsmQ9JL96 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtsmQ9JL96 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtsmQ9JL96 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CtsmQ9JL96 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtsmQ9JL96 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtsmQ9JL96 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtsmQ9JL96 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtsmQ9JL96 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtsmQ9JL96 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtsmQ9JL96 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtsmQ9JL96 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtsmQ9JL96 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtsmQ9JL96 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtsmQ9JL96 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtsmQ9JL96 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtsmQ9JL96 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtsmQ9JL96 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtsmQ9JL96 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtsmQ9JL96 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtsmQ9JL96 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtsmQ9JL96 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtsmQ9JL96 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtsmQ9JL96 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtsmQ9JL96 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtsmQ9JL96 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtsmQ9JL96 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtsmQ9JL96 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CtsmQ9JL96 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtsmQ9JL96 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtsmQ9JL96 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtsmQ9JL96 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtsmQ9JL96 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtsmQ9JL96 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtsmQ9JL96 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtsmQ9JL96 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtsmQ9JL96 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtsmQ9JL96 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CtsmQ9JL96 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtsmQ9JL96 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtsmQ9JL96 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtsmQ9JL96 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CtsmQ9JL96 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtsmQ9JL96 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtsmQ9JL96 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtsmQ9JL96 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtsmQ9JL96 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtsmQ9JL96 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtsmQ9JL96 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtsmQ9JL96 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtsmQ9JL96 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtsmQ9JL96 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms