Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL61

Rfx5, DNA-binding protein Rfx5, mousemouse

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Length 658 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx5Q9JL61 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfx5Q9JL61 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfx5Q9JL61 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfx5Q9JL61 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfx5Q9JL61 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfx5Q9JL61 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfx5Q9JL61 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfx5Q9JL61 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfx5Q9JL61 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfx5Q9JL61 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfx5Q9JL61 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfx5Q9JL61 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfx5Q9JL61 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfx5Q9JL61 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfx5Q9JL61 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfx5Q9JL61 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfx5Q9JL61 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfx5Q9JL61 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfx5Q9JL61 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfx5Q9JL61 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfx5Q9JL61 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfx5Q9JL61 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfx5Q9JL61 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfx5Q9JL61 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfx5Q9JL61 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfx5Q9JL61 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfx5Q9JL61 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfx5Q9JL61 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfx5Q9JL61 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfx5Q9JL61 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfx5Q9JL61 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfx5Q9JL61 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfx5Q9JL61 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfx5Q9JL61 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfx5Q9JL61 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfx5Q9JL61 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfx5Q9JL61 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfx5Q9JL61 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfx5Q9JL61 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfx5Q9JL61 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfx5Q9JL61 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfx5Q9JL61 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfx5Q9JL61 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfx5Q9JL61 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfx5Q9JL61 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfx5Q9JL61 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfx5Q9JL61 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfx5Q9JL61 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfx5Q9JL61 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfx5Q9JL61 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfx5Q9JL61 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfx5Q9JL61 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfx5Q9JL61 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfx5Q9JL61 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfx5Q9JL61 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfx5Q9JL61 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfx5Q9JL61 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfx5Q9JL61 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfx5Q9JL61 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfx5Q9JL61 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfx5Q9JL61 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfx5Q9JL61 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfx5Q9JL61 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfx5Q9JL61 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfx5Q9JL61 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfx5Q9JL61 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfx5Q9JL61 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfx5Q9JL61 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfx5Q9JL61 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfx5Q9JL61 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfx5Q9JL61 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfx5Q9JL61 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfx5Q9JL61 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rfx5Q9JL61 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rfx5Q9JL61 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rfx5Q9JL61 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rfx5Q9JL61 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rfx5Q9JL61 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rfx5Q9JL61 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rfx5Q9JL61 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rfx5Q9JL61 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rfx5Q9JL61 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rfx5Q9JL61 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rfx5Q9JL61 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rfx5Q9JL61 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rfx5Q9JL61 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rfx5Q9JL61 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rfx5Q9JL61 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rfx5Q9JL61 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rfx5Q9JL61 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rfx5Q9JL61 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rfx5Q9JL61 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rfx5Q9JL61 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rfx5Q9JL61 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rfx5Q9JL61 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rfx5Q9JL61 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rfx5Q9JL61 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rfx5Q9JL61 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rfx5Q9JL61 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rfx5Q9JL61 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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