Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gde1Q9JL56 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gde1Q9JL56 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gde1Q9JL56 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gde1Q9JL56 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gde1Q9JL56 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gde1Q9JL56 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gde1Q9JL56 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gde1Q9JL56 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gde1Q9JL56 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gde1Q9JL56 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gde1Q9JL56 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gde1Q9JL56 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gde1Q9JL56 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gde1Q9JL56 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gde1Q9JL56 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gde1Q9JL56 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gde1Q9JL56 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gde1Q9JL56 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gde1Q9JL56 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gde1Q9JL56 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gde1Q9JL56 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gde1Q9JL56 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gde1Q9JL56 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gde1Q9JL56 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gde1Q9JL56 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gde1Q9JL56 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gde1Q9JL56 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gde1Q9JL56 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gde1Q9JL56 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gde1Q9JL56 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gde1Q9JL56 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gde1Q9JL56 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gde1Q9JL56 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gde1Q9JL56 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gde1Q9JL56 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gde1Q9JL56 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gde1Q9JL56 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gde1Q9JL56 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gde1Q9JL56 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gde1Q9JL56 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gde1Q9JL56 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gde1Q9JL56 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gde1Q9JL56 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gde1Q9JL56 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gde1Q9JL56 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gde1Q9JL56 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gde1Q9JL56 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gde1Q9JL56 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gde1Q9JL56 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gde1Q9JL56 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gde1Q9JL56 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gde1Q9JL56 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gde1Q9JL56 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gde1Q9JL56 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gde1Q9JL56 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gde1Q9JL56 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gde1Q9JL56 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gde1Q9JL56 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gde1Q9JL56 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gde1Q9JL56 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gde1Q9JL56 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gde1Q9JL56 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gde1Q9JL56 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gde1Q9JL56 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gde1Q9JL56 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gde1Q9JL56 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gde1Q9JL56 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gde1Q9JL56 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gde1Q9JL56 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gde1Q9JL56 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gde1Q9JL56 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gde1Q9JL56 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gde1Q9JL56 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gde1Q9JL56 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gde1Q9JL56 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gde1Q9JL56 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gde1Q9JL56 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gde1Q9JL56 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gde1Q9JL56 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gde1Q9JL56 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gde1Q9JL56 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gde1Q9JL56 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gde1Q9JL56 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gde1Q9JL56 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gde1Q9JL56 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gde1Q9JL56 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gde1Q9JL56 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gde1Q9JL56 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gde1Q9JL56 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gde1Q9JL56 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gde1Q9JL56 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gde1Q9JL56 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gde1Q9JL56 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gde1Q9JL56 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gde1Q9JL56 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gde1Q9JL56 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gde1Q9JL56 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gde1Q9JL56 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gde1Q9JL56 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.5 ms