Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKY0

Cnot9, CCR4-NOT transcription complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot9Q9JKY0 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Cnot9Q9JKY0 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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