Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ldb3Q9JKS4 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms