Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE2

Trem1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem1Q9JKE2 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trem1Q9JKE2 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trem1Q9JKE2 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trem1Q9JKE2 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Trem1Q9JKE2 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trem1Q9JKE2 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trem1Q9JKE2 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Trem1Q9JKE2 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Trem1Q9JKE2 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trem1Q9JKE2 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Trem1Q9JKE2 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trem1Q9JKE2 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trem1Q9JKE2 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trem1Q9JKE2 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trem1Q9JKE2 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Trem1Q9JKE2 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trem1Q9JKE2 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trem1Q9JKE2 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trem1Q9JKE2 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trem1Q9JKE2 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Trem1Q9JKE2 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trem1Q9JKE2 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trem1Q9JKE2 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Trem1Q9JKE2 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trem1Q9JKE2 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trem1Q9JKE2 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trem1Q9JKE2 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trem1Q9JKE2 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trem1Q9JKE2 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trem1Q9JKE2 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trem1Q9JKE2 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trem1Q9JKE2 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trem1Q9JKE2 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trem1Q9JKE2 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trem1Q9JKE2 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trem1Q9JKE2 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trem1Q9JKE2 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trem1Q9JKE2 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trem1Q9JKE2 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trem1Q9JKE2 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trem1Q9JKE2 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trem1Q9JKE2 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trem1Q9JKE2 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trem1Q9JKE2 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trem1Q9JKE2 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trem1Q9JKE2 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trem1Q9JKE2 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trem1Q9JKE2 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trem1Q9JKE2 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trem1Q9JKE2 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trem1Q9JKE2 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trem1Q9JKE2 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trem1Q9JKE2 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trem1Q9JKE2 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trem1Q9JKE2 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trem1Q9JKE2 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Trem1Q9JKE2 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trem1Q9JKE2 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trem1Q9JKE2 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trem1Q9JKE2 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trem1Q9JKE2 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trem1Q9JKE2 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trem1Q9JKE2 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trem1Q9JKE2 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trem1Q9JKE2 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trem1Q9JKE2 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trem1Q9JKE2 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trem1Q9JKE2 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trem1Q9JKE2 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trem1Q9JKE2 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trem1Q9JKE2 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trem1Q9JKE2 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trem1Q9JKE2 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trem1Q9JKE2 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trem1Q9JKE2 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trem1Q9JKE2 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trem1Q9JKE2 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trem1Q9JKE2 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trem1Q9JKE2 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trem1Q9JKE2 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Trem1Q9JKE2 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trem1Q9JKE2 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trem1Q9JKE2 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trem1Q9JKE2 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trem1Q9JKE2 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trem1Q9JKE2 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trem1Q9JKE2 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Trem1Q9JKE2 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trem1Q9JKE2 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trem1Q9JKE2 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trem1Q9JKE2 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trem1Q9JKE2 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trem1Q9JKE2 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trem1Q9JKE2 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trem1Q9JKE2 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trem1Q9JKE2 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trem1Q9JKE2 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trem1Q9JKE2 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trem1Q9JKE2 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trem1Q9JKE2 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms