Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK83

Pard6b, Partitioning defective 6 homolog beta, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard6bQ9JK83 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pard6bQ9JK83 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms