Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIW5

Smad9, Mothers against decapentaplegic homolog 9, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad9Q9JIW5 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms