Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI57

Gtf2ird1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird1Q9JI57 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gtf2ird1Q9JI57 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gtf2ird1Q9JI57 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gtf2ird1Q9JI57 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gtf2ird1Q9JI57 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gtf2ird1Q9JI57 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gtf2ird1Q9JI57 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gtf2ird1Q9JI57 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gtf2ird1Q9JI57 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gtf2ird1Q9JI57 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gtf2ird1Q9JI57 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gtf2ird1Q9JI57 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gtf2ird1Q9JI57 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gtf2ird1Q9JI57 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gtf2ird1Q9JI57 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gtf2ird1Q9JI57 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Gtf2ird1Q9JI57 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Gtf2ird1Q9JI57 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gtf2ird1Q9JI57 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gtf2ird1Q9JI57 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gtf2ird1Q9JI57 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gtf2ird1Q9JI57 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gtf2ird1Q9JI57 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gtf2ird1Q9JI57 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gtf2ird1Q9JI57 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gtf2ird1Q9JI57 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gtf2ird1Q9JI57 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gtf2ird1Q9JI57 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gtf2ird1Q9JI57 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gtf2ird1Q9JI57 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gtf2ird1Q9JI57 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gtf2ird1Q9JI57 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Gtf2ird1Q9JI57 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtf2ird1Q9JI57 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtf2ird1Q9JI57 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtf2ird1Q9JI57 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtf2ird1Q9JI57 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtf2ird1Q9JI57 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtf2ird1Q9JI57 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtf2ird1Q9JI57 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtf2ird1Q9JI57 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtf2ird1Q9JI57 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtf2ird1Q9JI57 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtf2ird1Q9JI57 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtf2ird1Q9JI57 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtf2ird1Q9JI57 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtf2ird1Q9JI57 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtf2ird1Q9JI57 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtf2ird1Q9JI57 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtf2ird1Q9JI57 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtf2ird1Q9JI57 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtf2ird1Q9JI57 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtf2ird1Q9JI57 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtf2ird1Q9JI57 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtf2ird1Q9JI57 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtf2ird1Q9JI57 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtf2ird1Q9JI57 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf2ird1Q9JI57 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf2ird1Q9JI57 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf2ird1Q9JI57 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf2ird1Q9JI57 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf2ird1Q9JI57 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf2ird1Q9JI57 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf2ird1Q9JI57 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf2ird1Q9JI57 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf2ird1Q9JI57 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf2ird1Q9JI57 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf2ird1Q9JI57 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf2ird1Q9JI57 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf2ird1Q9JI57 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf2ird1Q9JI57 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf2ird1Q9JI57 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf2ird1Q9JI57 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf2ird1Q9JI57 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf2ird1Q9JI57 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf2ird1Q9JI57 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf2ird1Q9JI57 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf2ird1Q9JI57 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf2ird1Q9JI57 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf2ird1Q9JI57 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf2ird1Q9JI57 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf2ird1Q9JI57 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf2ird1Q9JI57 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf2ird1Q9JI57 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf2ird1Q9JI57 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf2ird1Q9JI57 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf2ird1Q9JI57 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf2ird1Q9JI57 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf2ird1Q9JI57 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf2ird1Q9JI57 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf2ird1Q9JI57 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf2ird1Q9JI57 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf2ird1Q9JI57 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf2ird1Q9JI57 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf2ird1Q9JI57 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf2ird1Q9JI57 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf2ird1Q9JI57 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf2ird1Q9JI57 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf2ird1Q9JI57 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf2ird1Q9JI57 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms