Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHF5

Tcirg1, V-type proton ATPase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcirg1Q9JHF5 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcirg1Q9JHF5 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcirg1Q9JHF5 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcirg1Q9JHF5 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcirg1Q9JHF5 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcirg1Q9JHF5 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcirg1Q9JHF5 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcirg1Q9JHF5 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcirg1Q9JHF5 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcirg1Q9JHF5 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcirg1Q9JHF5 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcirg1Q9JHF5 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcirg1Q9JHF5 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcirg1Q9JHF5 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcirg1Q9JHF5 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcirg1Q9JHF5 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcirg1Q9JHF5 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcirg1Q9JHF5 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tcirg1Q9JHF5 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tcirg1Q9JHF5 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tcirg1Q9JHF5 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tcirg1Q9JHF5 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tcirg1Q9JHF5 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tcirg1Q9JHF5 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tcirg1Q9JHF5 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tcirg1Q9JHF5 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tcirg1Q9JHF5 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tcirg1Q9JHF5 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tcirg1Q9JHF5 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tcirg1Q9JHF5 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tcirg1Q9JHF5 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tcirg1Q9JHF5 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tcirg1Q9JHF5 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tcirg1Q9JHF5 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tcirg1Q9JHF5 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tcirg1Q9JHF5 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tcirg1Q9JHF5 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tcirg1Q9JHF5 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tcirg1Q9JHF5 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tcirg1Q9JHF5 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tcirg1Q9JHF5 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tcirg1Q9JHF5 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tcirg1Q9JHF5 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tcirg1Q9JHF5 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tcirg1Q9JHF5 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tcirg1Q9JHF5 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tcirg1Q9JHF5 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tcirg1Q9JHF5 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tcirg1Q9JHF5 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tcirg1Q9JHF5 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tcirg1Q9JHF5 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tcirg1Q9JHF5 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tcirg1Q9JHF5 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tcirg1Q9JHF5 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tcirg1Q9JHF5 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tcirg1Q9JHF5 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tcirg1Q9JHF5 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tcirg1Q9JHF5 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tcirg1Q9JHF5 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tcirg1Q9JHF5 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tcirg1Q9JHF5 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcirg1Q9JHF5 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.1 ms