Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESW8

Pgpep1, Pyroglutamyl-peptidase 1, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgpep1Q9ESW8 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms