Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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OtofQ9ESF1 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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OtofQ9ESF1 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
OtofQ9ESF1 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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OtofQ9ESF1 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
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OtofQ9ESF1 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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OtofQ9ESF1 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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OtofQ9ESF1 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
OtofQ9ESF1 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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OtofQ9ESF1 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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OtofQ9ESF1 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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OtofQ9ESF1 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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OtofQ9ESF1 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
OtofQ9ESF1 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
OtofQ9ESF1 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
OtofQ9ESF1 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
OtofQ9ESF1 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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OtofQ9ESF1 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
OtofQ9ESF1 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
OtofQ9ESF1 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
OtofQ9ESF1 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
OtofQ9ESF1 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
OtofQ9ESF1 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
OtofQ9ESF1 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
OtofQ9ESF1 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
OtofQ9ESF1 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
OtofQ9ESF1 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
OtofQ9ESF1 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
OtofQ9ESF1 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
OtofQ9ESF1 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
OtofQ9ESF1 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
OtofQ9ESF1 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
OtofQ9ESF1 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
OtofQ9ESF1 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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