Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp29Q9ES63 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp29Q9ES63 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp29Q9ES63 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp29Q9ES63 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp29Q9ES63 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp29Q9ES63 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp29Q9ES63 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp29Q9ES63 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp29Q9ES63 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp29Q9ES63 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp29Q9ES63 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp29Q9ES63 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp29Q9ES63 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp29Q9ES63 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp29Q9ES63 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp29Q9ES63 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp29Q9ES63 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp29Q9ES63 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp29Q9ES63 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp29Q9ES63 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp29Q9ES63 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp29Q9ES63 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp29Q9ES63 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp29Q9ES63 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp29Q9ES63 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp29Q9ES63 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp29Q9ES63 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp29Q9ES63 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp29Q9ES63 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp29Q9ES63 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp29Q9ES63 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp29Q9ES63 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp29Q9ES63 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp29Q9ES63 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp29Q9ES63 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp29Q9ES63 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp29Q9ES63 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp29Q9ES63 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Usp29Q9ES63 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Usp29Q9ES63 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Usp29Q9ES63 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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