Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH7

Hipk3, Homeodomain-interacting protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hipk3Q9ERH7 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hipk3Q9ERH7 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.4 ms