Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER42

Barx1, Homeobox protein BarH-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barx1Q9ER42 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Barx1Q9ER42 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Barx1Q9ER42 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Barx1Q9ER42 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Barx1Q9ER42 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Barx1Q9ER42 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Barx1Q9ER42 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Barx1Q9ER42 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Barx1Q9ER42 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Barx1Q9ER42 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Barx1Q9ER42 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Barx1Q9ER42 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Barx1Q9ER42 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Barx1Q9ER42 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Barx1Q9ER42 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Barx1Q9ER42 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Barx1Q9ER42 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Barx1Q9ER42 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Barx1Q9ER42 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Barx1Q9ER42 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Barx1Q9ER42 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Barx1Q9ER42 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Barx1Q9ER42 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Barx1Q9ER42 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Barx1Q9ER42 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Barx1Q9ER42 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Barx1Q9ER42 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Barx1Q9ER42 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Barx1Q9ER42 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Barx1Q9ER42 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Barx1Q9ER42 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Barx1Q9ER42 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Barx1Q9ER42 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Barx1Q9ER42 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Barx1Q9ER42 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Barx1Q9ER42 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Barx1Q9ER42 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Barx1Q9ER42 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Barx1Q9ER42 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Barx1Q9ER42 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Barx1Q9ER42 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Barx1Q9ER42 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Barx1Q9ER42 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Barx1Q9ER42 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Barx1Q9ER42 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Barx1Q9ER42 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Barx1Q9ER42 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Barx1Q9ER42 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Barx1Q9ER42 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Barx1Q9ER42 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Barx1Q9ER42 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Barx1Q9ER42 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Barx1Q9ER42 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Barx1Q9ER42 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Barx1Q9ER42 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Barx1Q9ER42 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Barx1Q9ER42 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Barx1Q9ER42 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Barx1Q9ER42 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Barx1Q9ER42 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Barx1Q9ER42 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Barx1Q9ER42 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Barx1Q9ER42 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Barx1Q9ER42 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Barx1Q9ER42 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Barx1Q9ER42 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Barx1Q9ER42 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Barx1Q9ER42 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Barx1Q9ER42 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Barx1Q9ER42 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Barx1Q9ER42 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Barx1Q9ER42 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Barx1Q9ER42 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Barx1Q9ER42 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Barx1Q9ER42 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Barx1Q9ER42 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Barx1Q9ER42 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Barx1Q9ER42 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Barx1Q9ER42 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Barx1Q9ER42 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Barx1Q9ER42 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Barx1Q9ER42 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Barx1Q9ER42 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Barx1Q9ER42 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Barx1Q9ER42 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Barx1Q9ER42 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Barx1Q9ER42 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Barx1Q9ER42 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Barx1Q9ER42 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Barx1Q9ER42 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Barx1Q9ER42 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Barx1Q9ER42 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Barx1Q9ER42 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Barx1Q9ER42 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Barx1Q9ER42 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Barx1Q9ER42 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Barx1Q9ER42 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Barx1Q9ER42 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Barx1Q9ER42 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Barx1Q9ER42 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
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