Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ48

V1ra8, Vomeronasal type-1 receptor A8, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V1ra8Q9EQ48 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
V1ra8Q9EQ48 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
V1ra8Q9EQ48 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
V1ra8Q9EQ48 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
V1ra8Q9EQ48 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
V1ra8Q9EQ48 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
V1ra8Q9EQ48 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
V1ra8Q9EQ48 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
V1ra8Q9EQ48 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
V1ra8Q9EQ48 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
V1ra8Q9EQ48 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
V1ra8Q9EQ48 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
V1ra8Q9EQ48 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
V1ra8Q9EQ48 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
V1ra8Q9EQ48 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
V1ra8Q9EQ48 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
V1ra8Q9EQ48 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
V1ra8Q9EQ48 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
V1ra8Q9EQ48 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
V1ra8Q9EQ48 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
V1ra8Q9EQ48 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
V1ra8Q9EQ48 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
V1ra8Q9EQ48 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
V1ra8Q9EQ48 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
V1ra8Q9EQ48 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
V1ra8Q9EQ48 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
V1ra8Q9EQ48 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms