Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clstn1Q9EPL2 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clstn1Q9EPL2 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clstn1Q9EPL2 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clstn1Q9EPL2 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clstn1Q9EPL2 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clstn1Q9EPL2 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clstn1Q9EPL2 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Clstn1Q9EPL2 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Clstn1Q9EPL2 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Clstn1Q9EPL2 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Clstn1Q9EPL2 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Clstn1Q9EPL2 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Clstn1Q9EPL2 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Clstn1Q9EPL2 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Clstn1Q9EPL2 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Clstn1Q9EPL2 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Clstn1Q9EPL2 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Clstn1Q9EPL2 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Clstn1Q9EPL2 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Clstn1Q9EPL2 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Clstn1Q9EPL2 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Clstn1Q9EPL2 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Clstn1Q9EPL2 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Clstn1Q9EPL2 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Clstn1Q9EPL2 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Clstn1Q9EPL2 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Clstn1Q9EPL2 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Clstn1Q9EPL2 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Clstn1Q9EPL2 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Clstn1Q9EPL2 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Clstn1Q9EPL2 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Clstn1Q9EPL2 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Clstn1Q9EPL2 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Clstn1Q9EPL2 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Clstn1Q9EPL2 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Clstn1Q9EPL2 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Clstn1Q9EPL2 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Clstn1Q9EPL2 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Clstn1Q9EPL2 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Clstn1Q9EPL2 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Clstn1Q9EPL2 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Clstn1Q9EPL2 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Clstn1Q9EPL2 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Clstn1Q9EPL2 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Clstn1Q9EPL2 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Clstn1Q9EPL2 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Clstn1Q9EPL2 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Clstn1Q9EPL2 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Clstn1Q9EPL2 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Clstn1Q9EPL2 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Clstn1Q9EPL2 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Clstn1Q9EPL2 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Clstn1Q9EPL2 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Clstn1Q9EPL2 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Clstn1Q9EPL2 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Clstn1Q9EPL2 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Clstn1Q9EPL2 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Clstn1Q9EPL2 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Clstn1Q9EPL2 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Clstn1Q9EPL2 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Clstn1Q9EPL2 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Clstn1Q9EPL2 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Clstn1Q9EPL2 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Clstn1Q9EPL2 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Clstn1Q9EPL2 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Clstn1Q9EPL2 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Clstn1Q9EPL2 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Clstn1Q9EPL2 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Clstn1Q9EPL2 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Clstn1Q9EPL2 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Clstn1Q9EPL2 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Clstn1Q9EPL2 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Clstn1Q9EPL2 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Clstn1Q9EPL2 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Clstn1Q9EPL2 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Clstn1Q9EPL2 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Clstn1Q9EPL2 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Clstn1Q9EPL2 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Clstn1Q9EPL2 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Clstn1Q9EPL2 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Clstn1Q9EPL2 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Clstn1Q9EPL2 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Clstn1Q9EPL2 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Clstn1Q9EPL2 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Clstn1Q9EPL2 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Clstn1Q9EPL2 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Clstn1Q9EPL2 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Clstn1Q9EPL2 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Clstn1Q9EPL2 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Clstn1Q9EPL2 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Clstn1Q9EPL2 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Clstn1Q9EPL2 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Clstn1Q9EPL2 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Clstn1Q9EPL2 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Clstn1Q9EPL2 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Clstn1Q9EPL2 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Clstn1Q9EPL2 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Clstn1Q9EPL2 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Clstn1Q9EPL2 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms