Protein–RNA interactions for Protein: Q9EP53

Tsc1, Hamartin, mousemouse

Predictions only

Length 1,161 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsc1Q9EP53 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tsc1Q9EP53 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tsc1Q9EP53 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tsc1Q9EP53 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tsc1Q9EP53 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tsc1Q9EP53 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tsc1Q9EP53 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tsc1Q9EP53 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tsc1Q9EP53 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tsc1Q9EP53 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tsc1Q9EP53 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tsc1Q9EP53 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tsc1Q9EP53 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tsc1Q9EP53 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tsc1Q9EP53 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tsc1Q9EP53 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tsc1Q9EP53 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tsc1Q9EP53 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tsc1Q9EP53 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tsc1Q9EP53 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tsc1Q9EP53 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tsc1Q9EP53 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tsc1Q9EP53 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tsc1Q9EP53 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tsc1Q9EP53 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tsc1Q9EP53 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tsc1Q9EP53 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tsc1Q9EP53 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tsc1Q9EP53 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tsc1Q9EP53 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tsc1Q9EP53 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tsc1Q9EP53 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tsc1Q9EP53 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tsc1Q9EP53 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tsc1Q9EP53 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tsc1Q9EP53 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tsc1Q9EP53 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tsc1Q9EP53 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tsc1Q9EP53 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tsc1Q9EP53 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tsc1Q9EP53 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tsc1Q9EP53 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tsc1Q9EP53 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tsc1Q9EP53 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tsc1Q9EP53 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tsc1Q9EP53 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tsc1Q9EP53 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tsc1Q9EP53 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tsc1Q9EP53 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tsc1Q9EP53 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tsc1Q9EP53 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tsc1Q9EP53 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tsc1Q9EP53 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tsc1Q9EP53 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Tsc1Q9EP53 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tsc1Q9EP53 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Tsc1Q9EP53 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tsc1Q9EP53 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tsc1Q9EP53 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tsc1Q9EP53 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tsc1Q9EP53 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tsc1Q9EP53 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tsc1Q9EP53 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tsc1Q9EP53 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Tsc1Q9EP53 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tsc1Q9EP53 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tsc1Q9EP53 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tsc1Q9EP53 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tsc1Q9EP53 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tsc1Q9EP53 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tsc1Q9EP53 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tsc1Q9EP53 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tsc1Q9EP53 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tsc1Q9EP53 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tsc1Q9EP53 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Tsc1Q9EP53 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tsc1Q9EP53 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tsc1Q9EP53 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tsc1Q9EP53 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tsc1Q9EP53 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tsc1Q9EP53 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tsc1Q9EP53 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tsc1Q9EP53 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tsc1Q9EP53 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tsc1Q9EP53 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tsc1Q9EP53 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tsc1Q9EP53 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tsc1Q9EP53 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tsc1Q9EP53 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tsc1Q9EP53 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tsc1Q9EP53 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tsc1Q9EP53 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tsc1Q9EP53 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tsc1Q9EP53 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms