Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCU6

Mrpl4, 39S ribosomal protein L4, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl4Q9DCU6 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl4Q9DCU6 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl4Q9DCU6 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl4Q9DCU6 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl4Q9DCU6 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl4Q9DCU6 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl4Q9DCU6 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl4Q9DCU6 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl4Q9DCU6 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl4Q9DCU6 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl4Q9DCU6 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl4Q9DCU6 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl4Q9DCU6 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl4Q9DCU6 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl4Q9DCU6 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl4Q9DCU6 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl4Q9DCU6 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl4Q9DCU6 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl4Q9DCU6 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl4Q9DCU6 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl4Q9DCU6 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl4Q9DCU6 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl4Q9DCU6 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl4Q9DCU6 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl4Q9DCU6 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl4Q9DCU6 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mrpl4Q9DCU6 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mrpl4Q9DCU6 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mrpl4Q9DCU6 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mrpl4Q9DCU6 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mrpl4Q9DCU6 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mrpl4Q9DCU6 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mrpl4Q9DCU6 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mrpl4Q9DCU6 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mrpl4Q9DCU6 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mrpl4Q9DCU6 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Mrpl4Q9DCU6 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mrpl4Q9DCU6 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Mrpl4Q9DCU6 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mrpl4Q9DCU6 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Mrpl4Q9DCU6 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mrpl4Q9DCU6 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mrpl4Q9DCU6 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mrpl4Q9DCU6 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mrpl4Q9DCU6 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mrpl4Q9DCU6 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mrpl4Q9DCU6 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mrpl4Q9DCU6 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mrpl4Q9DCU6 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mrpl4Q9DCU6 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mrpl4Q9DCU6 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mrpl4Q9DCU6 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mrpl4Q9DCU6 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mrpl4Q9DCU6 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mrpl4Q9DCU6 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mrpl4Q9DCU6 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mrpl4Q9DCU6 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mrpl4Q9DCU6 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mrpl4Q9DCU6 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mrpl4Q9DCU6 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mrpl4Q9DCU6 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mrpl4Q9DCU6 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mrpl4Q9DCU6 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mrpl4Q9DCU6 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mrpl4Q9DCU6 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mrpl4Q9DCU6 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Mrpl4Q9DCU6 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mrpl4Q9DCU6 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mrpl4Q9DCU6 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mrpl4Q9DCU6 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mrpl4Q9DCU6 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mrpl4Q9DCU6 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mrpl4Q9DCU6 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mrpl4Q9DCU6 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mrpl4Q9DCU6 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mrpl4Q9DCU6 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mrpl4Q9DCU6 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mrpl4Q9DCU6 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mrpl4Q9DCU6 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mrpl4Q9DCU6 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mrpl4Q9DCU6 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl4Q9DCU6 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl4Q9DCU6 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl4Q9DCU6 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl4Q9DCU6 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl4Q9DCU6 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl4Q9DCU6 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl4Q9DCU6 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl4Q9DCU6 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl4Q9DCU6 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl4Q9DCU6 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl4Q9DCU6 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl4Q9DCU6 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl4Q9DCU6 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl4Q9DCU6 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl4Q9DCU6 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl4Q9DCU6 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl4Q9DCU6 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl4Q9DCU6 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl4Q9DCU6 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms