Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms