Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBY0

Foxp4, Forkhead box protein P4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxp4Q9DBY0 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Foxp4Q9DBY0 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Foxp4Q9DBY0 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Foxp4Q9DBY0 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Foxp4Q9DBY0 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Foxp4Q9DBY0 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Foxp4Q9DBY0 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Foxp4Q9DBY0 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Foxp4Q9DBY0 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Foxp4Q9DBY0 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Foxp4Q9DBY0 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Foxp4Q9DBY0 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Foxp4Q9DBY0 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Foxp4Q9DBY0 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Foxp4Q9DBY0 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Foxp4Q9DBY0 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Foxp4Q9DBY0 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Foxp4Q9DBY0 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Foxp4Q9DBY0 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Foxp4Q9DBY0 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Foxp4Q9DBY0 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Foxp4Q9DBY0 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Foxp4Q9DBY0 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Foxp4Q9DBY0 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Foxp4Q9DBY0 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Foxp4Q9DBY0 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Foxp4Q9DBY0 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Foxp4Q9DBY0 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Foxp4Q9DBY0 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Foxp4Q9DBY0 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Foxp4Q9DBY0 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Foxp4Q9DBY0 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Foxp4Q9DBY0 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Foxp4Q9DBY0 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Foxp4Q9DBY0 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Foxp4Q9DBY0 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Foxp4Q9DBY0 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Foxp4Q9DBY0 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Foxp4Q9DBY0 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Foxp4Q9DBY0 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Foxp4Q9DBY0 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Foxp4Q9DBY0 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Foxp4Q9DBY0 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Foxp4Q9DBY0 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Foxp4Q9DBY0 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Foxp4Q9DBY0 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Foxp4Q9DBY0 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Foxp4Q9DBY0 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Foxp4Q9DBY0 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Foxp4Q9DBY0 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Foxp4Q9DBY0 AC107452.3-201ENSMUST00000228807 1308 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Foxp4Q9DBY0 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Foxp4Q9DBY0 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Foxp4Q9DBY0 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Foxp4Q9DBY0 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Foxp4Q9DBY0 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Foxp4Q9DBY0 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Foxp4Q9DBY0 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Foxp4Q9DBY0 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Foxp4Q9DBY0 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Foxp4Q9DBY0 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Foxp4Q9DBY0 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Foxp4Q9DBY0 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Foxp4Q9DBY0 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Foxp4Q9DBY0 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Foxp4Q9DBY0 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Foxp4Q9DBY0 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Foxp4Q9DBY0 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Foxp4Q9DBY0 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Foxp4Q9DBY0 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Foxp4Q9DBY0 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Foxp4Q9DBY0 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Foxp4Q9DBY0 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Foxp4Q9DBY0 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Foxp4Q9DBY0 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Foxp4Q9DBY0 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Foxp4Q9DBY0 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Foxp4Q9DBY0 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Foxp4Q9DBY0 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Foxp4Q9DBY0 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Foxp4Q9DBY0 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Foxp4Q9DBY0 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Foxp4Q9DBY0 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Foxp4Q9DBY0 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Foxp4Q9DBY0 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Foxp4Q9DBY0 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Foxp4Q9DBY0 Gm5083-202ENSMUST00000163056 1204 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Foxp4Q9DBY0 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Foxp4Q9DBY0 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Foxp4Q9DBY0 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Foxp4Q9DBY0 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Foxp4Q9DBY0 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Foxp4Q9DBY0 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Foxp4Q9DBY0 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Foxp4Q9DBY0 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Foxp4Q9DBY0 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Foxp4Q9DBY0 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Foxp4Q9DBY0 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Foxp4Q9DBY0 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Foxp4Q9DBY0 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms