Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Ccdc97Q9DBT3 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms