Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAK3

Rhobtb1, Rho-related BTB domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 695 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb1Q9DAK3 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhobtb1Q9DAK3 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhobtb1Q9DAK3 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhobtb1Q9DAK3 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhobtb1Q9DAK3 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhobtb1Q9DAK3 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhobtb1Q9DAK3 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhobtb1Q9DAK3 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhobtb1Q9DAK3 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhobtb1Q9DAK3 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhobtb1Q9DAK3 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhobtb1Q9DAK3 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhobtb1Q9DAK3 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhobtb1Q9DAK3 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhobtb1Q9DAK3 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhobtb1Q9DAK3 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhobtb1Q9DAK3 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhobtb1Q9DAK3 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhobtb1Q9DAK3 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhobtb1Q9DAK3 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhobtb1Q9DAK3 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhobtb1Q9DAK3 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhobtb1Q9DAK3 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhobtb1Q9DAK3 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhobtb1Q9DAK3 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhobtb1Q9DAK3 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhobtb1Q9DAK3 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhobtb1Q9DAK3 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhobtb1Q9DAK3 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhobtb1Q9DAK3 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhobtb1Q9DAK3 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhobtb1Q9DAK3 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhobtb1Q9DAK3 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhobtb1Q9DAK3 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhobtb1Q9DAK3 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhobtb1Q9DAK3 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhobtb1Q9DAK3 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhobtb1Q9DAK3 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhobtb1Q9DAK3 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhobtb1Q9DAK3 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhobtb1Q9DAK3 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhobtb1Q9DAK3 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhobtb1Q9DAK3 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhobtb1Q9DAK3 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhobtb1Q9DAK3 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhobtb1Q9DAK3 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhobtb1Q9DAK3 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhobtb1Q9DAK3 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhobtb1Q9DAK3 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhobtb1Q9DAK3 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhobtb1Q9DAK3 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhobtb1Q9DAK3 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhobtb1Q9DAK3 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhobtb1Q9DAK3 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhobtb1Q9DAK3 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhobtb1Q9DAK3 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhobtb1Q9DAK3 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhobtb1Q9DAK3 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhobtb1Q9DAK3 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhobtb1Q9DAK3 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhobtb1Q9DAK3 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhobtb1Q9DAK3 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhobtb1Q9DAK3 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhobtb1Q9DAK3 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhobtb1Q9DAK3 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhobtb1Q9DAK3 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhobtb1Q9DAK3 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhobtb1Q9DAK3 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhobtb1Q9DAK3 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhobtb1Q9DAK3 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhobtb1Q9DAK3 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhobtb1Q9DAK3 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhobtb1Q9DAK3 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhobtb1Q9DAK3 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhobtb1Q9DAK3 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhobtb1Q9DAK3 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhobtb1Q9DAK3 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhobtb1Q9DAK3 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhobtb1Q9DAK3 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhobtb1Q9DAK3 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhobtb1Q9DAK3 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhobtb1Q9DAK3 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhobtb1Q9DAK3 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhobtb1Q9DAK3 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhobtb1Q9DAK3 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhobtb1Q9DAK3 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhobtb1Q9DAK3 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhobtb1Q9DAK3 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhobtb1Q9DAK3 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhobtb1Q9DAK3 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhobtb1Q9DAK3 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhobtb1Q9DAK3 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhobtb1Q9DAK3 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhobtb1Q9DAK3 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhobtb1Q9DAK3 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhobtb1Q9DAK3 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhobtb1Q9DAK3 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhobtb1Q9DAK3 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhobtb1Q9DAK3 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhobtb1Q9DAK3 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
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