Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA80

Rsph3b, Radial spoke head protein 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph3bQ9DA80 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rsph3bQ9DA80 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rsph3bQ9DA80 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rsph3bQ9DA80 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rsph3bQ9DA80 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rsph3bQ9DA80 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rsph3bQ9DA80 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rsph3bQ9DA80 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rsph3bQ9DA80 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rsph3bQ9DA80 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rsph3bQ9DA80 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rsph3bQ9DA80 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rsph3bQ9DA80 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rsph3bQ9DA80 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rsph3bQ9DA80 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rsph3bQ9DA80 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rsph3bQ9DA80 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rsph3bQ9DA80 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rsph3bQ9DA80 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rsph3bQ9DA80 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rsph3bQ9DA80 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rsph3bQ9DA80 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rsph3bQ9DA80 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rsph3bQ9DA80 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rsph3bQ9DA80 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rsph3bQ9DA80 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rsph3bQ9DA80 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rsph3bQ9DA80 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rsph3bQ9DA80 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rsph3bQ9DA80 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rsph3bQ9DA80 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rsph3bQ9DA80 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rsph3bQ9DA80 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rsph3bQ9DA80 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rsph3bQ9DA80 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rsph3bQ9DA80 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rsph3bQ9DA80 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rsph3bQ9DA80 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rsph3bQ9DA80 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rsph3bQ9DA80 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rsph3bQ9DA80 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rsph3bQ9DA80 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rsph3bQ9DA80 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rsph3bQ9DA80 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rsph3bQ9DA80 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rsph3bQ9DA80 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rsph3bQ9DA80 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rsph3bQ9DA80 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rsph3bQ9DA80 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rsph3bQ9DA80 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rsph3bQ9DA80 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rsph3bQ9DA80 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rsph3bQ9DA80 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rsph3bQ9DA80 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rsph3bQ9DA80 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rsph3bQ9DA80 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rsph3bQ9DA80 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rsph3bQ9DA80 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rsph3bQ9DA80 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rsph3bQ9DA80 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rsph3bQ9DA80 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rsph3bQ9DA80 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rsph3bQ9DA80 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rsph3bQ9DA80 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rsph3bQ9DA80 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rsph3bQ9DA80 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rsph3bQ9DA80 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rsph3bQ9DA80 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rsph3bQ9DA80 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rsph3bQ9DA80 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rsph3bQ9DA80 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rsph3bQ9DA80 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rsph3bQ9DA80 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rsph3bQ9DA80 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rsph3bQ9DA80 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rsph3bQ9DA80 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rsph3bQ9DA80 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rsph3bQ9DA80 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rsph3bQ9DA80 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rsph3bQ9DA80 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rsph3bQ9DA80 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rsph3bQ9DA80 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rsph3bQ9DA80 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rsph3bQ9DA80 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rsph3bQ9DA80 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rsph3bQ9DA80 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rsph3bQ9DA80 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rsph3bQ9DA80 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rsph3bQ9DA80 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rsph3bQ9DA80 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rsph3bQ9DA80 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rsph3bQ9DA80 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rsph3bQ9DA80 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rsph3bQ9DA80 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rsph3bQ9DA80 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rsph3bQ9DA80 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rsph3bQ9DA80 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rsph3bQ9DA80 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rsph3bQ9DA80 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rsph3bQ9DA80 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms