Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA08

Sgf29, SAGA-associated factor 29, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgf29Q9DA08 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sgf29Q9DA08 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms