Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T7

Slirp, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlirpQ9D8T7 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SlirpQ9D8T7 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SlirpQ9D8T7 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SlirpQ9D8T7 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SlirpQ9D8T7 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SlirpQ9D8T7 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SlirpQ9D8T7 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SlirpQ9D8T7 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SlirpQ9D8T7 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SlirpQ9D8T7 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SlirpQ9D8T7 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SlirpQ9D8T7 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SlirpQ9D8T7 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SlirpQ9D8T7 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SlirpQ9D8T7 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SlirpQ9D8T7 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SlirpQ9D8T7 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SlirpQ9D8T7 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SlirpQ9D8T7 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SlirpQ9D8T7 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SlirpQ9D8T7 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SlirpQ9D8T7 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SlirpQ9D8T7 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SlirpQ9D8T7 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SlirpQ9D8T7 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SlirpQ9D8T7 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SlirpQ9D8T7 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SlirpQ9D8T7 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SlirpQ9D8T7 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SlirpQ9D8T7 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SlirpQ9D8T7 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SlirpQ9D8T7 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SlirpQ9D8T7 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SlirpQ9D8T7 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SlirpQ9D8T7 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SlirpQ9D8T7 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SlirpQ9D8T7 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
SlirpQ9D8T7 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SlirpQ9D8T7 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SlirpQ9D8T7 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SlirpQ9D8T7 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SlirpQ9D8T7 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SlirpQ9D8T7 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SlirpQ9D8T7 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SlirpQ9D8T7 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SlirpQ9D8T7 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SlirpQ9D8T7 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SlirpQ9D8T7 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SlirpQ9D8T7 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SlirpQ9D8T7 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SlirpQ9D8T7 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SlirpQ9D8T7 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SlirpQ9D8T7 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SlirpQ9D8T7 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SlirpQ9D8T7 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SlirpQ9D8T7 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SlirpQ9D8T7 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SlirpQ9D8T7 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SlirpQ9D8T7 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SlirpQ9D8T7 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SlirpQ9D8T7 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SlirpQ9D8T7 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SlirpQ9D8T7 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SlirpQ9D8T7 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SlirpQ9D8T7 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SlirpQ9D8T7 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SlirpQ9D8T7 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SlirpQ9D8T7 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SlirpQ9D8T7 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SlirpQ9D8T7 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SlirpQ9D8T7 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SlirpQ9D8T7 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SlirpQ9D8T7 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SlirpQ9D8T7 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SlirpQ9D8T7 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SlirpQ9D8T7 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SlirpQ9D8T7 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SlirpQ9D8T7 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SlirpQ9D8T7 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SlirpQ9D8T7 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SlirpQ9D8T7 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SlirpQ9D8T7 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SlirpQ9D8T7 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SlirpQ9D8T7 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SlirpQ9D8T7 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SlirpQ9D8T7 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SlirpQ9D8T7 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SlirpQ9D8T7 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SlirpQ9D8T7 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SlirpQ9D8T7 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SlirpQ9D8T7 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SlirpQ9D8T7 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SlirpQ9D8T7 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SlirpQ9D8T7 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SlirpQ9D8T7 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SlirpQ9D8T7 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SlirpQ9D8T7 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SlirpQ9D8T7 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SlirpQ9D8T7 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SlirpQ9D8T7 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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