Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms