Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S1

Tmem54, Transmembrane protein 54, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem54Q9D7S1 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmem54Q9D7S1 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmem54Q9D7S1 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmem54Q9D7S1 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmem54Q9D7S1 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmem54Q9D7S1 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmem54Q9D7S1 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmem54Q9D7S1 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmem54Q9D7S1 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmem54Q9D7S1 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmem54Q9D7S1 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmem54Q9D7S1 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmem54Q9D7S1 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmem54Q9D7S1 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmem54Q9D7S1 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmem54Q9D7S1 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmem54Q9D7S1 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmem54Q9D7S1 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmem54Q9D7S1 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmem54Q9D7S1 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmem54Q9D7S1 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmem54Q9D7S1 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmem54Q9D7S1 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmem54Q9D7S1 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmem54Q9D7S1 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmem54Q9D7S1 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmem54Q9D7S1 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmem54Q9D7S1 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmem54Q9D7S1 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmem54Q9D7S1 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmem54Q9D7S1 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmem54Q9D7S1 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmem54Q9D7S1 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmem54Q9D7S1 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmem54Q9D7S1 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmem54Q9D7S1 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmem54Q9D7S1 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmem54Q9D7S1 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmem54Q9D7S1 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmem54Q9D7S1 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmem54Q9D7S1 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmem54Q9D7S1 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmem54Q9D7S1 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmem54Q9D7S1 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmem54Q9D7S1 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmem54Q9D7S1 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmem54Q9D7S1 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmem54Q9D7S1 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmem54Q9D7S1 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmem54Q9D7S1 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmem54Q9D7S1 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmem54Q9D7S1 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmem54Q9D7S1 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmem54Q9D7S1 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmem54Q9D7S1 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmem54Q9D7S1 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmem54Q9D7S1 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmem54Q9D7S1 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmem54Q9D7S1 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmem54Q9D7S1 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmem54Q9D7S1 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmem54Q9D7S1 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmem54Q9D7S1 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmem54Q9D7S1 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmem54Q9D7S1 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmem54Q9D7S1 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmem54Q9D7S1 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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Tmem54Q9D7S1 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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Tmem54Q9D7S1 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmem54Q9D7S1 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmem54Q9D7S1 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmem54Q9D7S1 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmem54Q9D7S1 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmem54Q9D7S1 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmem54Q9D7S1 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmem54Q9D7S1 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmem54Q9D7S1 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmem54Q9D7S1 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmem54Q9D7S1 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmem54Q9D7S1 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmem54Q9D7S1 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmem54Q9D7S1 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmem54Q9D7S1 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmem54Q9D7S1 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tmem54Q9D7S1 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tmem54Q9D7S1 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tmem54Q9D7S1 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tmem54Q9D7S1 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tmem54Q9D7S1 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tmem54Q9D7S1 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tmem54Q9D7S1 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tmem54Q9D7S1 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmem54Q9D7S1 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmem54Q9D7S1 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmem54Q9D7S1 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmem54Q9D7S1 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmem54Q9D7S1 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmem54Q9D7S1 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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