Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y1

Ccdc3, Coiled-coil domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 273 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc3Q9D6Y1 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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Ccdc3Q9D6Y1 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Ccdc3Q9D6Y1 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Ccdc3Q9D6Y1 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Ccdc3Q9D6Y1 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Ccdc3Q9D6Y1 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Ccdc3Q9D6Y1 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Ccdc3Q9D6Y1 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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